Applied Biosystems™ TaqPath™ ProAmp™ Master Mix

Designad för multiplex SNP-genotypning

En TaqMan™ SNP Genotyping Assay riktar sig mot ett enda SNP-locus (en specifik genomisk position) och inkluderar två PCR-primers och två allelespecifika prober. Varje prob hybridiserar till samma genomiska region men skiljer sig med en nukleotid, vilket möjliggör detektion av en av de två möjliga allelerna vid det locuset. Denna design möjliggör alleldiskriminering inom en enda qPCR-reaktion.

TaqPath™ ProAmp™ Master Mix stöder singleplex- och multiplex-SNP-genotypning, inklusive 2-SNP-multiplexkonfigurationer (två SNP-loci per reaktion; totalt fyra allelspecifika prober). Denna multiplexeringsmetod ökar datautdata per prov samtidigt som den bibehåller säker alleldiskriminering och analysprestanda.

Sex SNP-loci per reaktionsmultiplexering kräver en anpassad TaqPath ProAmp formulering utan ROX.

Fördelar med TaqPath™ ProAmp™ Master Mix

• Exceptionell datakvalitet—, hög specificitet, reproducerbarhet och dynamiskt omfång* för SNP-genotypning och CNV-analys
• Hämmartolerans—robust med prover hämtade från blod, bukkala prover och kortstansare
• Optimerad för SNP-genotypning från råa lysater—stöder korrekt SNP-genotypning utan DNA-rening
• 72-timmars pre-PCR-bänkstabilitet med renat DNA—, idealiskt för automatiserade och höggenomströmningsarbetsflöden, möjliggjort av den proprietära Dual-Lock™ Taq DNA-hotstart-mekanismen
• Multiplexflexibilitet—stödjer singleplex till fyrmåls SNP-detektion per reaktion
• Tillverkningskonsistens—producerad i en ISO 13485-certifierad anläggning
• Efterlevnadspaketet som finns—inkluderar vanligt efterfrågad kvalitets- och regulatorisk dokumentation

Exakt SNP-genotypning från renat DNA eller råa lysater

TaqPath™ ProAmp™ Master Mix levererar exakta och reproducerbara SNP-genotypningsresultat från antingen renat genomiskt DNA eller råa lysatingångar. När den kombineras med DNA Extract All™ Reagents Kit stöder mastermixen robust singleplex- och 2-locus multiplex SNP-genotypning direkt från råa lysater framställda från blod- och buccala provtagningar.

Interna tester visade 100 % överensstämmelse mellan SNP-genotypsamtal från råa lysater och renat genomiskt DNA med utvalda 2-SNP multiplex assay-konfigurationer, vilket bekräftade tillförlitlig alleldiskriminering utan DNA-rening.

Exakt SNP-genotypning från grova lysater med förbättrad prestanda jämfört med alternativa mastermixar

I interna utvärderingar med SNP-genotypningsanalyser TaqMan™ och råa blodlysater TaqPath™ ProAmp™ visade Master Mix förbättrad noggrannhet i SNP-genotypanrop och tydligare alleldiskriminering jämfört med utvalda alternativa qPCR-mastermixar. Formuleringen gav tät genotypklusterseparation och konsekventa SNP-locusanrop över replikater, vilket stödjer säker genotypningsprestanda även i närvaro av inhibitorer som ofta finns i biologiska prover.

Högnoggrann kopiantalvariationsanalys (CNV)

Utöver SNP-genotypning TaqPath™ ProAmp™ stödjer Master Mix noggrann analys av kopinummervariation (CNV) när den används med renat genomiskt DNA. Indata från råa lysatprov rekommenderas inte för CNV-analys.

Formuleringen möjliggör tillförlitlig bestämning av kopiantal över flera genmål, inklusive CYP2D6 intron 2 och CYP2D6 intron 6, med noggrann kvantifiering i prover som innehåller en till fyra kopior. Interna jämförelser visade förbättrad kopieringstalsprecision och reproducerbarhet jämfört med utvalda alternativa qPCR-mastermixar när renat genomiskt DNA användes som indata.

Del av ett strömlinjeformat arbetsflöde från Sample-to-Genotype

TaqPath™ ProAmp™ Master Mix integreras sömlöst i ett komplett arbetsflöde från Sample till Genotype, inklusive:

• DNA-extraktreagenskit All™ för snabb framställning av råa lysater för SNP-genotypning
• TaqMan™ Fördesignade SNP-genotypningsanalyser eller TaqMan™ DME-genotypningsanalyser
• Renat genomiskt DNA för analys av kopinummervariation
• QuantStudio™ Realtids-PCR-instrument
• Diomni™ Design- och analysprogramvara för dataanalys av multiplexgenotypning

Detta arbetsflöde möjliggör snabbare hantering och minskad hands-on-tid för SNP-genotypning, samtidigt som det stödjer noggrann CNV-analys med renat DNA vid behov.

Allmänna reagenser tillverkade under cGMP

TaqPath™ Masterblandningar är allmänna reagenser märkta för laboratoriebruk och tillverkas i en ISO 13485-certifierad och FDA-registrerad anläggning som följer gällande principer för god tillverkningspraxis (cGMP).

Efterlevnadspaket

Ofta efterfrågade efterlevnadsdokument finns tillgängliga, inklusive:

• Kvalitetsuttalande som beskriver efterlevnad av cGMP
• Lot-specifikt analyscertifikat (COA)
• Produktstabilitetsuttalande
• Dokumentation för leverantörsutvärderingsstöd
• Genomförd självbedömning
• ISO certifikat per tillverkningsplats
• BSE/TSE-uttalande
• Ändringskontroll och registrering av aviseringar

För frågor relaterade till EU:s REACH-efterlevnad, mejla LSGChemicalCompliance@thermofisher.com.

Hittar du inte dokumentet du behöver? Teknisk support finns tillgänglig för att hjälpa till.

* Dynamiskt omfång beror på analysdesign, mallkoncentration och mastermixformulering; Individuella resultat kan variera.