Invitrogen™ Collibri™ Stranded RNA Library Prep Kit för Illumina™ System

De Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Preparation kits är designade för nästa generations sekvensering (NGS ) på Illumina system. Satsen stöder sekvensering av hela transkriptom (människa, mus, råtta) och mRNA-sekvensering (kompatibel med alla arter).

De Collibri Stranded RNA Library Preparation Kit:
• Innehåller alla nödvändiga komponenter i ett enda kit* för snabb användning
• Totalt RNA omvandlat till sekvenseringsfärdigt bibliotek inom 4,5 timmar
•> 98 % strängspecificitet, effektiv detektion av icke-kodande RNA och hög känslighet för differentiellt genuttryck
• Ger visuell feedback under processen för enklare hantering
• Är lämplig för konventionell automation för att

öka genomströmningen Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit för Illumina Systems är designat för robust konstruktion av cDNA-bibliotek för strängspecifik RNA-sekvensering Illumina nästa generations sekvensering (NGS ) system. Satsen sammanför de överlägsna funktionerna i SuperScript IV Reverse Transcriptase , Dynabeads magnetiska partiklar och platina SuperFi DNA-polymeras, som gör det möjligt för användare att få högkvalitativa sekvenseringsfärdiga bibliotek. Detta Collibri Stranded RNA Library Prep Kit stöder snabb biblioteksberedning inom 4,5 timmar för mRNA eller hela transkriptombibliotek med –1 25 ng mRNA-berikad eller ribodarmad RNA-provinmatning. Multiplexering av bibliotek kan utföras med hjälp av upp till 96 enkelindexerade eller unika dubbelindexerade primers, vilket möjliggör enkelläsning eller parad sekvensering. Satsen är lämplig för RNA-prover av olika kvalitet, inklusive FFPE-prover.

Visuella signaler om processintegritet
För maximal bekvämlighet ingår visuella signaler om processintegritet genom hela biblioteksförberedelsens arbetsflöde. Övervaka framstegen i biblioteksgenereringen med hjälp av visuell feedback från färgämnen i kritiska reagenser. Reaktionsblandningen ändrar färg som svar på tillsatsen av kritiska komponenter vid varje steg för att säkerställa att biblioteksberedningen har den högsta chansen att lyckas. De inerta färgämnena stör inte enzymatiska reaktioner och äventyrar inte sekvenseringsresultaten.

Hur det fungerar
Fullängds Illumina-kompatibla adaptrar introduceras genom PCR-förstärkning med Platinum SuperFi DNA-polymeras för att konstruera enkelindexerade eller unika dubbelindexerade bibliotek som är kompatibla med enkelläsnings- eller paradändssekvensering. Kitet innehåller 24 eller 96 antingen enkelindexerade streckkodade PCR-primers (i7) förblandade med en universell i5-primer eller unika dubbelindexade PCR-primers som möjliggör multiplexering av upp till 96 bibliotek. Optimerade rengöringssteg tar effektivt bort kvarvarande primers och adapter/primer-dimerer samtidigt som höga biblioteksutbyten bevaras.

En relaterad produkt, den Collibri Library Quantification Kit, rekommenderas för qPCR-baserade kvantifieringar av bibliotek innan du fortsätter till sekvensering.

Ansökningar
De Collibri Stranded RNA Library Prep Kit rekommenderas för:
•Studier av genuttryck
• Alternativ skarvningsanalys
• Icke-kodande RNA-detektion och upptäckt
• Identifiering av alternativa polyadenyleringsställen
• Detektion av genfusion
• Detektion av transkriptisoformer

* Satsen består av enzymatisk modifiering, storleksval/rengöring och indexerade adapterinnehållande moduler. Ytterligare ribodepletion-modul av human/mus/råtta rRNA kan också inkluderas.