Invitrogen™ Dimeric cyanin nukleinsyrafläckar

Dessa åtta spektralt distinkta dimera cyanin-nukleinsyrafärger är bland de fluorescerande proberna med högst känslighet som finns tillgängliga för nukleinsyrafärgning. Karbocyanindimererna har mycket stark bindningsaffinitet för dsDNA, med dissociationskonstanter i det mikromolära området och nukleinsyrabindande affiniteter större än deras modermonomerfärgämnen. Förutom sin höga affinitet för nukleinsyror är cyanindimerer väsentligen icke-fluorescerande i frånvaro av nukleinsyror och uppvisar 100- till 1000-faldiga fluorescensförbättringar vid bindning till DNA. Extinktionskoefficienterna och fluorescenskvantutbytena för cyanindimererna bundna till DNA är höga, vilket resulterar i mycket ljusa fluorescenssignaler.

Funktioner hos de dimera cyanin-nukleinsyrafärgerna:
• Hög affinitet —stark bindningsaffinitet för dsDNA med dissociationskonstanter i det mikromolära området
•Låg icke-fluorescerande bakgrund —i frånvaro av nukleinsyror
•Stor fluorescensförbättring —100- till 1000-faldig fluorescensförbättring vid bindning till DNA
•Ljus fluorescens —höga extinktionskoefficienter och fluorescenskvantutbyten vilket resulterar i mycket ljusa fluorescenssignaler

De dimera cyaninfärgämnena är användbara för många tillämpningar inklusive fluorescensmikroskopi och flödescytometri. Dessa färgämnen är ogenomträngliga för livskraftiga celler och kan användas som indikatorer för döda celler. Deras ljusa fluorescenssignaler och låga bakgrunder gör dem idealiska för färgning av nukleinsyror på fasta underlag, såsom mikroarrayer. De är också användbara som nukleära och kromosommotfärgningar för flerfärgsfluorescensmärkningsexperiment såsom i immunhistokemi (IHC) och immuncytokemi (ICC). Förfärgning av nukleinsyraprover före gel- eller kapillärelektrofores är också möjligt på grund av den extraordinära stabiliteten hos färgämnes-nukleinsyrakomplexen.

De dimera cyanin-nukleinsyrafärgerna levereras i en enhetsstorlek på 200μ L som 1 mM lösningar i dimetylsulfoxid (DMSO) eller dimetylformamid (DMF) för POPO-3-färgningen. Fluorescensspektra för de åtta dimera cyanin-nukleinsyrafärgerna täcker hela det synliga våglängdsområdet och varje färgämne skiljer sig i extinktionskoefficient och kvantutbyte.

POPO™ -1 jodid (434/456)
Den blåfluorescerande POPO-1-färgen har excitations-/emissionsmaxima∼ 434/456 nm när bunden till dsDNA i vattenlösning. Den kan exciteras av ultravioletta (UV) excitationskällor och Hg-bågen (endast) 436 nm-lasern.

BOBO™ -1 jodid (462/481)
Den blåfluorescerande BOBO-1-färgen har excitations-/emissionsmaxima∼ 462/481 nm när bunden till dsDNA i vattenlösning. Den kan exciteras av ultravioletta (UV) excitationskällor och He-Cd 442 nm laser.

JOJO™ -1 jodid (491/509)
En av våra nukleinsyrafärger med högsta affinitet, den grönfluorescerande YOYO-1-färgningen visar över 1000-faldig ökning av fluorescens när den binds till dsDNA. Den har excitations/emissionsmaxima∼ 491/509 nm när den är bunden till nukleinsyror och kan exciteras av ultravioletta (UV) excitationskällor och Ar 488 nm-lasern. YOYO-1-färgning har visat sig vara extremt användbar vid analys av enskilda DNA-molekyler och används i superupplösningsmikroskopiapplikationer som STORM.

TOTO™ -1 jodid (514/533)
Den grönfluorescerande TOTO-1-färgen har excitations-/emissionsmaxima∼ 514/533 nm när bunden till dsDNA i vattenlösning. Det DNA-bundna TOTO-1-färgämnet har också en kortvåglängdstopp vid∼ 275 nm och kan exciteras av ultravioletta (UV) excitationskällor och Ar 514 nm laser.

POPO™ -3 jodid (534/570)
Den gulfluorescerande POPO-3-färgen har excitations-/emissionsmaxima∼ 534/570 nm när bunden till dsDNA i vattenlösning. Den kan exciteras av He-Ne 543 nm-lasern.

BOBO™ -3 jodid (570/602)
Den orange-fluorescerande BOBO-3-färgen har excitations-/emissionsmaxima∼ 570/602 nm när bunden till dsDNA i vattenlösning. Den kan exciteras av Kr 568 nm-lasern.

JOJO™ -3 jodid (612/631)
Den orange-fluorescerande YOYO-3-färgen har excitations-/emissionsmaxima∼ 612/631 nm när bunden till dsDNA i vattenlösning. Den kan exciteras av He-Ne 594 nm-lasern.

TOTO™ -3 jodid (642/660)
Den långt röda fluorescerande TOTO-3-färgen har excitations-/emissionsmaxima∼ 640/660 nm när bunden till dsDNA i vattenlösning. Den kan exciteras av He-Ne 633 nm-lasern. Den långvågiga fluorescensen för TOTO-3-färgning liknar Alexa Fluor 647 eller Cy5 färgämnen och är väl separerad från den för vanliga fluoroforer, som t.ex Alexa Fluor färgämnen, Oregon Green, fluorescein (FITC), rhodamin (TRITC), Texas Red, kumarin (AMCA), Marina Blue och Pacific Blue färgämnen. Dessutom har långvågiga –ljusabsorberande färgämnen såsom TOTO-3-färgning fördelen att deras fluorescens vanligtvis inte skyms av autofluorescensen av vävnader.

TOTO-3-färgning har hög selektivitet för nukleär över cytoplasmatisk färgning, vilket gör den användbar som en nukleär motfärgning och indikator för döda celler, och är bland de mest känsliga sonderna för nukleinsyradetektering. TOTO-3-färgning ger stark och selektiv nukleär färgning i odlade celler och i paraffinsnitt. Samtidig märkning med grönt fluorescerande SYTO färgämne och cellogenomtränglig TOTO-3-färgning används ofta för att bedöma cellviabilitet. TOTO-3 har en mycket högre extinktionskoefficient än DNA-bunden propidiumjodid och har använts för unika tillämpningar som att detektera mikrobiella celler och mikroorganismer i markmiljöer.

Nukleinsyrafläckar Dimer Provtagningssats
För forskare som designar nya applikationer tillhandahåller Nucleic Acid Stains Dimer Sampler Kit prover av de åtta spektralt distinkta analogerna av de dimera cyaninfärgämnena för testning. Detta kit innehåller 25μ L var och en av följande nukleinsyrafärger med hög affinitet baserad på symmetriska dimerer av cyaninfärgämnen:
• BOBO-1 jodid (kat. nr. B3582)
• BOBO-3 jodid (kat. nr. B3586)
• POPO-1-jodid (kat.nr. P3580)
• POPO-3-jodid (kat.nr. P3584)
• TOTO-1 jodid (kat. nr. T3600)
• TOTO-3-jodid (kat.nr. T3604)
• YOYO-1 jodid (kat. nr. Y3601)
• YOYO-3 jodid (kat. nr. Y3603)