Thermo Scientific™ L-Proline för SILAC

Allmänna egenskaper hos tunga och lätta aminosyror för SILAC märkning:

• Effektiv—100 % etikettinkorporering i proteiner i levande celler
• Flexibla—olika isotoper av tunga och/eller lätta aminosyror för arginin, lysin, leucin och prolin möjliggör kvantifiering av peptider härledda från MS-graders proteaser
• Multiplex-funktioner—finns flera alternativa isotoper av arginin och lysin tillgängliga som möjliggör analys av flera behandlingsförhållanden i varje experiment
• Högkvalitativa kosttillskott—innehåller tunga aminosyror med >99 % isotoprenhet

Stabil isotopmärkning med aminosyror i cellkultur (SILAC) är en kraftfull metod för att identifiera och kvantifiera relativa differentierade förändringar i komplexa proteinprover. Denna metod innebär in vivo metabolisk inkorporering av 'tunga' ¹³C- eller ¹⁵N-märkta aminosyror i proteiner, följt av masspektrometri (MS) för accelererad och omfattande identifiering, karaktärisering och kvantifiering av proteiner.

Thermo Scientific Tunga och lätta aminosyror används SILAC tillsammans med specialiserade cellodlingsmedier som saknar essentiella aminosyror. Tunga och lätta L-lysin samt L-arginin är de vanligaste aminosyrorna som används vid SILAC analys av tryptiska peptider. Upp till tre olika experimentella förhållanden kan enkelt analyseras med olika isotoper av lysin och arginin. För lysin tre-plex-experiment används 4,4,5,5-D₄ L-lysin och ¹³C₆ ¹⁵N₂ L-lysin för att generera peptider med 4- respektive 8-Da massskift, jämfört med peptider som genereras med lätt lysin. För arginin tre-plex-experiment används ¹³C₆ L-arginin och ¹³C₆ ¹⁵N₄ L-arginin för att generera peptider med 6- respektive 10-Da massskift, jämfört med peptider som genereras med lätt arginin. L-leucin är en annan aminosyra som ofta används för SILAC märkning, eftersom det är en av de vanligaste aminosyrorna som finns i proteinsekvenser. Prolin är en icke-essensiell aminosyra som ibland tillsätts i SILAC medier för att förhindra den metabola omvandlingen av tung arginin till tung prolin i däggdjurscellinjer med hög arginindehydrogenasaktivitet.

Relaterade produkter

• L-Arginin-HCl för SILAC (Cat. Nr. 89989)
• L-Leucin för SILAC (Kat. Nr. 88428)
• L-Lysine-2HCl för SILAC (Cat. Nr. 89987)