Thermo Scientific™ Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit

De Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit för Illumina Systems är designat för den robusta konstruktionen av cDNA-bibliotek för strängspecifik RNA-sekvensering Illumina nästa generations sekvensering (NGS ) system. Modulerna sammanför de överlägsna funktionerna i SuperScript IV Reverse Transcriptase , Dynabeads magnetiska partiklar och platina SuperFi DNA-polymeras, som gör det möjligt för användare att få högkvalitativa, sekvenseringsfärdiga bibliotek.

Detta Collibri Stranded RNA Library Prep Kit Modules stöder snabb biblioteksförberedelse inom 4,5 timmar för mRNA eller hela transkriptombibliotek med –1 25 ng mRNA-berikad eller ribodarmad RNA-provinmatning. Multiplexering av bibliotek kan utföras med hjälp av upp till 96 enkelindexerade eller unika dubbelindexerade primers, vilket möjliggör enkelläsning eller parad sekvensering. Satsen är lämplig för RNA-prover av olika kvalitet, inklusive FFPE-prover.

Visuella ledtrådar för processintegritet
För maximal bekvämlighet ingår visuella ledtrådar för processintegritet genom hela biblioteksförberedelsens arbetsflöde. Övervaka framstegen i biblioteksgenereringen med hjälp av visuell feedback från färgämnen i kritiska reagenser. Reaktionsblandningen ändrar färg som svar på tillsatsen av kritiska komponenter vid varje steg för att säkerställa att biblioteksberedningen har den högsta chansen att lyckas. De inerta färgämnena stör inte enzymatiska reaktioner och äventyrar inte sekvenseringsresultaten.

Hur det fungerar
Fullängds Illumina-kompatibla adaptrar introduceras genom PCR-förstärkning med Platinum SuperFi DNA-polymeras för att konstruera enkelindexerade eller unika dubbelindexerade bibliotek som är kompatibla med enkelläsnings- eller paradändssekvensering. Kitet innehåller 24 eller 96 antingen enkelindexerade streckkodade PCR-primers (i7) förblandade med en universell i5-primer eller unika dubbelindexade PCR-primers som möjliggör multiplexering av upp till 96 bibliotek. Optimerade rengöringssteg tar effektivt bort kvarvarande primers och adapter/primer-dimerer samtidigt som höga biblioteksutbyten bevaras.

En relaterad produkt, den Collibri Library Quantification Kit, rekommenderas för qPCR-baserade kvantifieringar av bibliotek innan du fortsätter till sekvensering.

Applikationer
The Collibri Stranded RNA Library Prep Kit rekommenderas för:
• Studier av genuttryck
• Alternativ skarvningsanalys
• Icke-kodande RNA-detektion och upptäckt
• Identifiering av alternativa polyadenyleringsställen
• Detektion av genfusion
• Detektion av transkriptisoformer