Thermo Scientific™ Pierce™ TMT11plex Yeast Digest Standard

Pierce TMT11plex Yeast Digest Standard består av fyra medfödda stammar av Saccharomyces cerevisiae (en föräldralinje, BY4741, och tre linjer som saknar de icke-essentiella proteinerna Met6, His4 eller Ura2) märkta i tre exemplar (knock-out-stammar) eller duplikat (förälderreagens-1-märkt) eller duplikat (förälder-1-märkt). Knock-out-stammarna används i kombination med föräldrastammen för att möjliggöra jämförelse av peptid- och proteinöverflöd för kvantifiering. Pierce TMT11plex Yeast Digest Standard:
•Bekvämt —bruksfärdigt lyofiliserat pulver förmärkt med TMT11plex-reagens
•Kvalitetsjäststammar verifierade —för genotyp, ekvimolär blandning av de TMT-märkta stammarna
•Kvantitativt mått den —kvantitativa precisionen av TMT reporterjoner för 11 kanaler
•Diagnostiskt utmärkt QC-analysverktyg —för proteinkvantifiering med hjälp av TMT på LC-MS/MS-instrument

Kvantitativa proteomiska strategier med hjälp av TMT reagenser möjliggör multiplexering och exakt mätning av proteinöverflöd. Framgångsrik utförande av TMT kvantifiering inkluderar optimerad kromatografi, masspektrometri (MS) och dataanalys. En kritisk parameter för framgång i detta arbetsflöde är förmågan att konsekvent detektera TMT fragmentera joner över 11 kanaler för multiplexering. Vår TMT11plex Yeast Digest-standard har utformats speciellt för att bedöma LC-MS/MS-systemprestanda för TMT kvantifiering, MS metodoptimering och systemvalidering. För metodutveckling kan TMT11plex Yeast Digest Standard användas för att mäta noggrannheten, precisionen och det dynamiska omfånget för olika masspektrometrimetoder. Dessa standarder kan hjälpa till att optimera offlinefraktionering, kromatografi, masspektrometriinsamling och dataanalysinställningar. Multifunktionella applikationer som använder denna standard minskar variabiliteten mellan experimenten för att tillhandahålla reproducerbar TMT kvantifiering.

Referenser:
1. Paulo JA, O'Connell JD, Gygi SP . En trippel knockout (TKO ) Proteomics Standard för diagnostisering av joninterferens i isobariska märkningsexperiment. J Am Soc Mass Spectrom. 2016 10:1620-5.
2. Yang F, Shen Y, Camp DG 2nd, Smith RD. Hög-pH omvänd faskromatografi med fraktionssammansättning för 2D proteomisk analys. Expert Rev Proteomics . 2012 9(2):129-34.
3. Dayon L, Pasquarello C, Hoogland C, Sanchez JC, Scherl A. Kombinera låg- och högenergi tandemmasspektra för optimerad peptidkvantifiering med isobariska taggar. J Proteomics . 2010 73(4):769-77.
4. Diedrich JK, Pinto AF, Yates JR 3rd. Energiberoende av HCD på peptidfragmentering: stegrad kollisionsenergi hittar sweet spot. J Am Soc Mass Spectrom. 2013 24(11):1690-9.
5. Chiva C, Sabidó E. Enbart HCD-fragmenteringsmetod balanserar peptididentifiering och kvantifiering av TMT-märkta prover i hybrid linjär jonfälla/orbitrap-masspektrometrar. J Proteomics . 2014 96:263-70.

Relaterade produkter:
Pierce HeLa Protein Digest Standard (Kat. nr. 88329)
Pierce Peptide Retention Time Kalibreringsblandning (Kat. nr. 88321)
TMT10plex isobarisk etikettreagenssats plus TMT11-131C etikettreagens (kat.nr. A34808)