Applied Biosystems™ Protein Thermal Shift™ Programvara v1.4

Olika proteiner kommer att ha olika Protein Thermal Shift™ profiler, var och en med en unik proteinsmältkurvaform, lutning, signal-brusförhållande och temperatursmältområde (se bilden till höger för ett exempel). De Protein Thermal Shift™ Programvara genererar ett eller flera smälttemperaturvärden (Tm) från dessa kurvor med två metoder: den Boltzmann-härledda Tm och den härledda kurvan-bestämda Tm, för att tjäna som jämförelsepunkter mellan kurvorna och representera den relativa termiska stabiliteten för proteinet under olika testbetingelser.

Två metoder för att generera Tm-värde
Boltzmann-metoden anpassar data inom ett automatiskt (eller manuellt) identifierat smältområde till Boltzmann-modellen med två tillstånd för att generera Tm. Typiskt, för proteiner med en enda smältdomän, används Boltzmann-metoden. Men för proteiner med flera smältdomäner kan metoden Derivative Curve användas. Metoden för derivatkurvan använder en numeriskt beräknad andraderivata av rådata för att uppskatta de temperaturer där upp till sex toppar (lokala maxima) kan inträffa i derivatprofilen. En empiriskt härledd tröskel för signal-brusförhållandet används för att bestämma vilka lokala maxima som kommer att detekteras.

Kompatibel med våra realtids PCR-system
Protein Thermal Shift™ analysprogramvara är kompatibel med körfiler som genereras från dessa realtids-PCR-system: QuantStudioTM 3, 5, 6, 6 Pro, 7, 7 Pro och 12K Flex, StepOne™ , StepOnePlus™ , 7500, 7500 Fast och ViiA 7.™

Förbered dina prover med hjälp av vår Protein Thermal Shift™ Kit
Förbered dina prover för analys med hjälp av vår Protein Thermal Shift™ Startpaket eller Protein Thermal Shift™ Dye Kit (tillgänglig separat). Dessa kit tillåter användare att använda ett färgämne som binder till exponerade hydrofoba rester för att övervaka den termiska stabiliteten hos proteiner med hjälp av ett realtids-PCR-instrument för att identifiera buffertförhållanden som stabiliserar proteinet av intresse eller screena bibliotek av ligander för föreningar som binder proteinet av intresse.