Invitrogen™ SYTO™ Gröna fluorescerande nukleinsyrafläckar

SYTO Gröna fluorescerande nukleinsyrafläckar är cellgenomsläppliga nukleinsyrafläckar som visar en stor fluorescensförbättring vid bindning av nukleinsyror. De SYTO färgämnen kan användas för att färga RNA och DNA i både levande och döda eukaryota celler, såväl som i grampositiva och gramnegativa bakterier.

De SYTO fläckar delar flera viktiga egenskaper:
•Permeabilitet för praktiskt taget alla cellmembran, inklusive däggdjursceller och bakterier
• Hög molär absorptionsförmåga, med extinktionskoefficienter> 50 000 cm ^-1 M ^-1 vid synligt absorptionsmaxima
• Extremt låg inneboende fluorescens, med kvantutbyten typiskt< 0,01 när den inte är bunden till nukleinsyror
• Kvantutbyten som är typiskt> 0,4 när det är bundet till nukleinsyror.

SYTO Grönfluorescerande nukleinsyrafläckar excitation/emission:
•SYTO 9 —RNA 486/501 nm; DNA 485/498 nm
•SYTO 11 —RNA 510/530 nm; DNA 508/527 nm
•SYTO 12 —RNA 500/519 nm; DNA 499/522 nm
•SYTO 13 —RNA 491/514 nm; DNA 488/509 nm
•SYTO 14 —RNA 521/547 nm; DNA 517/549 nm
•SYTO 16 —RNA 494/525 nm; DNA 488/518 nm
•SYTO 21 —DNA 494/517 nm
•SYTO 24 —DNA 490/515 nm
•SYTO BC —RNA 487/504 nm; DNA 485/500 nm
•SYTO RNASelect— RNA 490/530 nm

SYTO färgämnen skiljer sig från varandra i en eller flera egenskaper, inklusive cellpermeabilitet, fluorescensförbättring vid bindning av nukleinsyror, excitations- och emissionsspektra, DNA/RNA-selektivitet och bindningsaffinitet. De SYTO färgämnen är kompatibla med en mängd olika fluorescensbaserade instrument som använder laserexcitering eller en konventionell bredbandsbelysningskälla (t.ex. kvicksilver- och xenonbågslampor). Filterset som är lämpliga för avbildning av celler märkta med fluorescein (FITC), Alexa Fluor 488, eller GFP kommer att fungera bra för avbildning av celler färgade med SYTO Gröna nukleinsyrafläckar.

SYTO nukleinsyrafärger har använts i olika applikationer från färgning av DNA prickigt på mikroarrayer till färgning av levande och fixerade celler. De SYTO färgämnen fungerar inte uteslutande som nukleära fläckar i levande celler och bör inte likställas med DNA-selektiva föreningar som DAPI (kat.nr. D1306, D21490) eller Hoechst 33342 (Kat. nr. H1399, H3570), som färgar kärnor i levande djurceller. Eukaryota celler inkuberade med SYTO färgämnen visar i allmänhet cytoplasmatisk eller mitokondriell färgning, såväl som nukleär färgning. De SYTO Gröna fluorescerande nukleinsyrafläckar har visat sig vara värdefulla i ett brett spektrum av forskningsapplikationer samt används i flödescytometri och fluorescensmikroskopi.

Specifika färgningsapplikationer för några av de SYTO Gröna fluorescerande nukleinsyrafläckar:
De SYTO 9 färg har visat sig färga levande och döda grampositiva och gramnegativa bakterier. Det är en del av LIVE/DEAD BacLight Bakteriell viabilitetssats (kat.nr. L7007, L7012, L13152).

De SYTO 11-färgning (kat.nr. S7573) har använts i samband med time-lapse-mikroskopi för att undersöka klyvningsorienteringen av delande celler i den utvecklande hjärnbarken.

De SYTO 13 färg (kat. nr. S7575) har använts i kombination med propidiumjodid (kat. nr. P1304, P3566) för att övervaka glutamatinducerad nekros i cerebellära granulceller.

De SYTO 14-färgning (kat.nr. S7576) binder till cytoplasmatiskt RNA, vilket tillåter dess användning för att spåra RNA-granultransport i levande neuroner.

Flera rapporter beskriver användningen av SYTO färgämnen för att upptäcka apoptos. En serie av SYTO nukleinsyrafärgningar screenades för förmågan att skilja mellan apoptotiska och icke-apoptotiska mustymocyter, och SYTO 16 färg (kat.nr. S7578) visade sig vara optimal för denna applikation. De SYTO 16-färgning har också använts med propidiumjodid för att skilja levande och döda COS-7-celler med en laserbaserad skanningscytometer.

De SYTO BC Green Fluorescent Nucleic Acid Stain är en blandning av några av våra bästa SYTO färgämnen för bakteriell färgning och är en komponent i Bacteria Counting Kit (kat.nr B7277) för bakterieräkning i flödescytometri.

De SYTO RNASelect Green Fluorescent Cell Stain är en cellgenomsläpplig nukleinsyrafärgning som selektivt färgar RNA. Även om praktiskt taget icke-fluorescerande i frånvaro av nukleinsyror, SYTO RNASelect fläcken uppvisar klargrön fluorescens när den är bunden till RNA (absorptions-/emissionsmaxima∼ 490/530 nm), men endast en svag fluorescerande signal när den är bunden till DNA. Det har använts för att färga RNA-last i exosomer i både levande cellprov och isolerade exosomer.

SYTO Grönt fluorescerande nukleinsyrafläckarsats
De SYTO Green Fluorescent Nucleic Acid Stain Sampler Kit #1 innehåller vår samling av cellgenomsläppliga, grön-fluorescerande SYTO nukleinsyrafläckar. Eftersom färgämnena kan visa olika färgningsbeteenden med olika vävnader och celler, kan det vara nödvändigt att testa färgämnena för att hitta det optimala färgämnet för en specifik tillämpning. Satsen innehåller 50 stμ L var och en av SYTO –11 14, 16, 21 och 24 färgämnen.

Vilken fysiologisk buffert som helst mellan –pH 7,0 8,0, inklusive PBS, kan användas för att späda ut SYTO färgämnen för färgningslösningen.