Applied Biosystems™ TaqMan™ Copy Number Reference Assay, human, TERT

Mänsklig TaqMan™ Kopianummerreferensanalyser körs med människa TaqMan™ Copy Number Assays i en duplex realtids-PCR-reaktion för att upptäcka och mäta kopietalsvariationer (CNV) och mindre regioner i det mänskliga genomet. Två alternativ för gener som kan användas som endogena referensgener hos människor erbjuds: RNase P och TERT. TaqMan™ Kopieringsnummerreferensanalyser är utformade för unika genomiska sekvenser i referensgenomsammansättningen (Build 37/hg19) och krävs för relativ kvantifiering av kopiantalmål.

TaqMan™ Copy Number Assays kvantifierar genen av intresse och normaliserar till en endogen referensgen som är känd för att finnas i två kopior i ett diploid genom. Observera det TaqMan™ Kopianummerreferensanalyser är artspecifika.

TERT: Alternativet för alternativ referensgen
TaqMan™ Kopianummerreferensanalyser har en VIC™ färgämne –märkt TAMRA™ sond- och –referenssekvensspecifika framåt- och bakåtprimrar. Analyserna är inte primerbegränsade.

TaqMan™ Kopianummerreferensanalys RNase P rekommenderas som standardreferensanalys för kopietalsanalys. Denna analys detekterar ribonukleas P RNA-komponent H1 (H1RNA) genen (RPPH1) på kromosom 14, cytoband 14q11.2. Analysplatsen är chr.14:20811565 på NCBI build 37. Den har ett 87 bp amplikon som kartläggs inom den enda exon RPPH1-genen.

TaqMan™ Kopianummerreferensanalys TERT är en alternativ referensanalys; det rekommenderas i händelse av att RNase P-analysen fungerar dåligt med ett prov på grund av kromosomavvikelser eller andra problem. Denna analys riktar sig mot genen för telomeras omvänt transkriptas (TERT) som finns på kromosom 5, cytoband 5p15.33. Analysplatsen är chr.5:1253373 på NCBI build 37. Den har ett 88 bp amplikon som kartläggs inom exon 16 av TERT-genen.

Enklaste arbetsflödet för analys av kopior
TaqMan™ Kopieringsnummeranalyser har det enklaste arbetsflödet av alla för närvarande tillgängliga analysmetoder för kopianummer. Testanalysen (FAM™ färgämne märkt), –referensanalysen (VIC™ färgämne märkt), ditt –prov-DNA och TaqMan™ Master Mix kombineras och körs sedan på en Applied Biosystems™ realtids PCR-system som använder standarden TaqMan™ Kopiera nummer analysprotokoll. I genomsnitt tar installationen för primär analys bara –3 4 timmar (inklusive en cirka 2 timmars PCR-körning).

Kraftfull programvara för dataanalys
CopyCaller™ Programvaran utvecklades speciellt för TaqMan™ Copy Number Assay dataanalys. Denna gratis, lättanvända programvara använder ett grafiskt gränssnitt som snabbt beräknar möjliga kopior för en uppsättning prover i en körning. Det ger också ett konfidensvärde för varje kopianummersamtal, och har avvikande funktionalitet.

Endast för forskning. Inte avsedd för human eller animalisk teurapeutisk eller diagnostisk användning