Applied Biosystems™ TaqMan™ Kopieringsnummerreferensanalys, mus, Tfrc

Mus TaqMan® Kopinummerreferensanalyser körs med fördesignade, Custom Plus och Custom TaqMan® Kopieringsnummeranalyser i en duplex, realtids-PCR-reaktion för att upptäcka och mäta variationer i antal kopior i musgenomet. Mus TaqMan® Kopinummerreferensanalyser är också kompatibla med den förutdesignade vanliga vektormarkören och reportergenen TaqMan® Kopieringsnummeranalyser. Två alternativ för gener som kan användas som endogena referensgener hos möss erbjuds: Tfrc och Tert. TaqMan® Copy Number Reference Assays är utformade för unika genomiska sekvenser i musreferensgenomsammansättningen (NCBI Build 37/mm9) och krävs för relativ kvantifiering av kopiantalmål.

TaqMan® Copy Number Assays kvantifierar genen av intresse och normaliserar till en endogen referensgen som är känd för att finnas i två kopior i ett diploid genom. Observera det TaqMan® Kopianummerreferensanalyser är artspecifika.

Tfrc: Standardreferensgenalternativet
TaqMan® Kopianummerreferensanalyser har en VIC® färgämnesmärkt TAMRA™ prob och referenssekvensspecifika framåt- och bakåtprimrar. Analyserna är inte primerbegränsade.

TaqMan® Kopieringsnummerreferensanalys, mus, Tfrc rekommenderas som standardreferensanalys för kopietalsanalys på möss. Denna analys detekterar transferrinreceptorgenen (Tfrc) på kromosom 16, cytoband 16qB3. Analysplatsen är chr.16:32626732 på NCBI build 37. Den har ett 91 bp amplikon som kartläggs inom exon 17 av Tfrc-genen.

TaqMan® Copy Number Reference Assay, Mus, Tert är en alternativ referensanalys; det rekommenderas i händelse av att Tfrc-analysen fungerar dåligt med ett prov på grund av kromosomavvikelser eller andra problem. Analysen riktar sig mot genen för telomeras omvänt transkriptas (Tert) på kromosom 13, cytoband 13qC1. Analysplatsen är chr.13:73778992 på NCBI build 37. Den har en 96 bp amplikon som kartläggs inom intron 8 av Tert-genen.

Enklaste tillgängliga arbetsflödet
TaqMan® Copy Number Assays har det enklaste arbetsflödet av alla för närvarande tillgängliga CNV-analysmetoder. Testanalysen (FAM™ färgämne märkt), referensanalysen (VIC® färgämne märkt), ditt prov-DNA och TaqMan® Master Mix kombineras och körs sedan på en Applied Biosystems® Realtids PCR-system som använder standarden TaqMan® Kopiera nummer analysprotokoll. I genomsnitt tar inställningen till primär analys endast 3-4 timmar (inklusive en cirka 2 timmars PCR-körning).

Kraftfull programvara för dataanalys
® CopyCaller-mjukvaran utvecklades speciellt för TaqMan® Copy Number Assay dataanalys. Denna gratis, lättanvända programvara använder ett grafiskt gränssnitt som snabbt beräknar möjliga kopior för en uppsättning prover i en körning. Det ger också ett konfidensvärde för varje kopianummersamtal, och har avvikande funktionalitet.

Endast för forskning. Inte avsedd för human eller animalisk teurapeutisk eller diagnostisk användning