Invitrogen™ QuantiGene™ Plex Mänsklig virusvärdpanel, 50-plex

Funktioner i QuantiGene Plex Human Virus-Host Panel, 50-plex, inkluderar:

• Sann multiplexering—mäter 50 gener av intresse och hushållsgener i samma brunn utan korsreaktivitet
• Anpassning av svåra provtyper—fungerar med nedbrutet och korslänkat RNA i FFPE-vävnader och blod
• Standardiserad plattform—använder 96- eller 384-brunnsplattor som är kompatibla med Luminex 200, MagPix och FlexMap3D-system
• Ett enkelt arbetsflöde—använder ett ELISA-liknande arbetsflöde med direkt hybridisering av transkript till pärlor och transkriptsmärkning
• Stort lager av validerade mål, — om ytterligare mål behöver läggas till i denna panel, välj bland över 22 000 gener för att skapa rutor med väg- och sjukdomstema
• Snabb leverans för anpassade paneler—. Om vi inte har din(a) gener, kan vi skapa en anpassad panel inom tre veckor

QuantiGene Plex Analyser är hybridiseringsbaserade analyser för direkt kvantifiering av RNA direkt från celllysater, vävnadshomogenater eller renat RNA, och de möjliggör mätning av flera mål i samma brunn via multiplexering. QuantiGene Plex Analyser innehåller två komponenter: ett mål-specifikt probset och magnetiska fångstpärlor. De använder mål-specifika prober för att fånga det RNA av intresse, och förgrenad DNA-teknologi förstärker sedan fluorescerande signaler som läses med ett Luminex xMAP instrument.

Mål: SARS-CoV-2 panprobe (orf1ab, membranglykoprotein, nukleokapsid), ORF3a, ORF7a, ORF8, RdRP/NSP12, S-protein, TMPRSS2, ACE2, AT2, NF-Bκ, DPP4 (CD26), Envelope Protein, Influenza Pan Probe, RSV Pan Probe, CD4, CD8a, HLA-DR, CD38, CD25, CD14, CD19, RORc, TBX21, GATA3, NCAM1 (CD56), CD11d, IFITM1, CCL2 (MCP-1), CCL3 (MIP-1a), IFNg, Il12A, IL6, IL8a, IL1b, IFNa, Il10, IL2, TNFa, IL4, Granzyme B, IL18, IP10 (CXCL10), GM-CSF, IL17A (CTLA8), VEGF-A, GAPDH, GUSB, HPRT1, PPIB, RPL13A

Teknologi

QuantiGene Plex Analyser använder förgrenad DNA (bDNA)-teknik. Först lyseras celler (eller blod) eller vävnadsprover (inklusive FFPE) homogeniseras för att frigöra mål-RNA. För det andra inkuberas oligonukleotidproben med mål-RNA och Luminex xMAP pärlset över natten. Under denna inkubation hybridiserar proberna samarbetsvilligt till mål- och fångaproberna bundna till varje pärla och fångar mål-RNA:t. För det tredje utförs signalförstärkning via sekventiell hybridisering av bDNA-förförstärkare-, förstärkar- och etikettprobmolekylerna till målet. Tillsats av streptavidin-fykoerytrin genererar en luminescerande signal direkt proportionell mot mängden mål-mRNA som finns i provet. Detta möjliggör (relativ) kvantifiering av genuttryck och med denna specifika panel möjliggör studier av virusinfektionsprocesser, människans (värdens) immunprofil och cytokinstormbiomarkörer, samt förekomst av SARS-CoV-2 och utvalda influensa och RSV stammar.

Användningsområden

QuantiGene Plex Analysforskningsapplikationer inkluderar compoundscreening för läkemedelsupptäckt, biomarkörverifiering, siRNA-knockdown-effektivitet, prospektiv och/eller retrospektiv analys av kliniska prövningsprover, validering av mikroarrayer, prediktiv toxikologi samt detektion av translokationer och fusionsgener.